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質(zhì)粒電轉(zhuǎn)整合穩(wěn)定細(xì)胞株

產(chǎn)品描述
周期報(bào)價(jià)
案例展示

名詞定義

電穿孔,也稱為電通透化,是一種高效的非病毒遞送系統(tǒng),可使遺傳物質(zhì)(DNA和RNA)、蛋白質(zhì)、藥物或其他分子進(jìn)入細(xì)胞。它利用精確的脈沖電流在細(xì)胞膜上制造臨時(shí)孔隙,使分子能夠通過(guò)。
 

一旦質(zhì)粒DNA進(jìn)入細(xì)胞,就可能作用于細(xì)胞。遺傳物質(zhì)可能保持獨(dú)立(以質(zhì)粒的形式,未整合),也可能根據(jù)后續(xù)實(shí)驗(yàn)步驟整合到宿主基因組中。




工作原理

     
      體外電穿孔時(shí),將靶細(xì)胞懸浮液與待導(dǎo)入細(xì)胞的質(zhì)粒DNA在導(dǎo)電溶液中混合,然后放入比色皿中(圖1)。電穿孔比色皿的樣品室兩側(cè)各有一塊金屬板,電流可以通過(guò)混合物。將比色皿放入電穿孔儀的腔室中,該腔室配有相應(yīng)的電觸點(diǎn),使比色皿形成電路。電穿孔儀上的控制器允許用戶設(shè)置待輸送電脈沖的電壓、波形和持續(xù)時(shí)間,這些參數(shù)應(yīng)根據(jù)靶細(xì)胞類型進(jìn)行優(yōu)化。然后,電脈沖通過(guò)樣品室。



圖 1:裝有比色皿的電穿孔儀主要部件示意圖。圖片來(lái)源:Richard Wheeler
 

      電脈沖擾亂細(xì)胞膜的磷脂雙層,從而形成孔隙(圖 2)。這種過(guò)程是不對(duì)稱的,孔隙首先在細(xì)胞的陽(yáng)極側(cè)形成。同時(shí),跨膜電位增加。這驅(qū)使帶電分子(例如質(zhì)粒DNA)首先吸附到細(xì)胞陰極側(cè)的膜上,然后穿過(guò)這些孔隙進(jìn)入細(xì)胞 (圖 3)。
 


圖2:電穿孔過(guò)程中細(xì)胞膜破壞和孔隙形成的示意圖。圖片來(lái)源:Technology Networks。

圖3:示意圖顯示了電穿孔過(guò)程中將外源物質(zhì)(在本例中為質(zhì)粒)引入細(xì)胞的步驟和相關(guān)電荷。圖片來(lái)源:Technology Networks。
 

優(yōu)缺點(diǎn)

優(yōu)點(diǎn)

缺點(diǎn)

操作相對(duì)簡(jiǎn)單

需要專用儀器

對(duì)轉(zhuǎn)染難度較大的細(xì)胞類型效果良好

參數(shù)必須經(jīng)過(guò)仔細(xì)優(yōu)化

無(wú)載體要求,甚至不需要載體

對(duì)細(xì)胞損傷較大,部分無(wú)法恢復(fù)而死亡

對(duì)細(xì)胞類型的依賴性小

/

快遞轉(zhuǎn)染大量細(xì)胞,相對(duì)成本低

/

可以轉(zhuǎn)染含有細(xì)胞壁的物種

/



關(guān)鍵參數(shù)

      制定電穿孔方案時(shí),重要的是選擇合適的參數(shù),使其能夠?qū)崿F(xiàn)通透性,同時(shí)最大程度地減少對(duì)細(xì)胞膜的干擾,以最大限度地提高細(xì)胞活力、實(shí)驗(yàn)可重復(fù)性和效率。需要考慮的因素包括:

1. 波形:指數(shù)衰減脈沖、方波脈沖

方波脈沖迅速上升到設(shè)定電壓,維持該水平,然后在脈沖結(jié)束時(shí)迅速截止;指數(shù)衰減波的電壓迅速上升到目標(biāo)值,然后隨時(shí)間下降。一般而言,哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)染選擇方波脈沖比較多;

2. 脈沖時(shí)間:針對(duì)方波脈沖,一般是直接設(shè)置持續(xù)時(shí)間;指數(shù)衰減脈沖會(huì)隨著時(shí)間延長(zhǎng),電壓逐漸降低,一般用時(shí)間常數(shù)TC表示,需要結(jié)合對(duì)細(xì)胞的損傷來(lái)優(yōu)化;

3. 場(chǎng)強(qiáng):指施加于電極間隙的電壓,這個(gè)電壓跟很多因素有關(guān),比如比色皿的間隙、細(xì)胞的大小、溫度等。

4. 緩沖液:緩沖液的電阻、鹽濃度、緩存能力都會(huì)影響電轉(zhuǎn)效果,比如有些敏感細(xì)胞更喜歡培養(yǎng)基組份;

5. 溫度:高功率一般傾向于低溫,比如冰上操作;

6. pH變化:電極電解可能引起pH變化,可以通過(guò)緩沖液調(diào)整;

7. 細(xì)胞數(shù)量:細(xì)胞過(guò)密會(huì)導(dǎo)致電弧放電,過(guò)稀會(huì)降低陽(yáng)性比率;

8. 細(xì)胞質(zhì)量:因?yàn)殡娹D(zhuǎn)本身對(duì)細(xì)胞有損傷,因此被電轉(zhuǎn)的細(xì)胞質(zhì)量尤為重要,一般是選擇健康、無(wú)污染、分裂活躍、代數(shù)低的細(xì)胞;

9. 質(zhì)粒質(zhì)量:質(zhì)量差或者污染的質(zhì)粒DNA會(huì)降低電轉(zhuǎn)效率;

其他:比色皿表面的水份、高鹽、氣泡等,都可以引起電弧放電。

 

瞬時(shí)表達(dá)和穩(wěn)定整合

      常見(jiàn)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染,沒(méi)有定點(diǎn)的、特殊的整合機(jī)制,因此當(dāng)質(zhì)粒被遞送到細(xì)胞核中,整合是隨機(jī)發(fā)生的,而且只有一小部分質(zhì)粒會(huì)隨著細(xì)胞DNA復(fù)制過(guò)程中的斷裂,經(jīng)過(guò)修復(fù)機(jī)制的作用,被整合到宿主的染色體基因組中。
 
      因此我們總結(jié)幾個(gè)重要的特點(diǎn):
1.隨機(jī)整合,整合效率低,不一定會(huì)整合到轉(zhuǎn)錄活躍區(qū);
2.大量未整合的質(zhì)粒(以1x10e6轉(zhuǎn)染5 μg為例,以pcDNA3.1載體加上3000bp的目的基因?yàn)槔?,大約是5.37*10e11 copies),隨著細(xì)胞分裂慢慢被稀釋或降解;
3.一般24-96小時(shí)會(huì)形成一個(gè)瞬時(shí)表達(dá)的最高峰;
4.被整合的拷貝需要經(jīng)過(guò)抗性(antibiotic)篩選得到陽(yáng)性細(xì)胞,并且后期需要抗性維持壓力;
5.因?yàn)槭峭ㄟ^(guò)DNA斷裂修復(fù)重組進(jìn)去的,所以后期也存在這個(gè)位置再次斷裂的可能性,進(jìn)而破壞了目的基因,因此可以說(shuō)穩(wěn)定性是個(gè)挑戰(zhàn),建議做單克隆穩(wěn)定細(xì)胞株,做傳代穩(wěn)定性分析;
6.線性DNA比環(huán)狀DNA整合得更有效率,但是線性DNA比環(huán)狀DNA更難遞送;
7.不同細(xì)胞類型差異較大,表現(xiàn)在“遞送差異”和“整合差異”上;
8.被遞送的質(zhì)粒要去內(nèi)毒素,內(nèi)毒素會(huì)引起免疫反應(yīng)。

 

應(yīng)用場(chǎng)景

1

瞬時(shí)轉(zhuǎn)染,追求瞬間高拷貝/超拷貝的蛋白表達(dá);

2

穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建,生物安全等級(jí)低,對(duì)整和效率、整合位置要求不高。


 

穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建服務(wù)

科佰生物提供“質(zhì)粒電轉(zhuǎn)整合系統(tǒng)”穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建服務(wù),利用該系統(tǒng),我們已經(jīng)成功構(gòu)建超過(guò)300株穩(wěn)定細(xì)胞株的模型,有著豐富的經(jīng)驗(yàn),歡迎溝通咨詢。


質(zhì)粒轉(zhuǎn)染

病毒感染

Flp-FRT系統(tǒng)

轉(zhuǎn)座子系統(tǒng)

基因編輯

 

脂質(zhì)體

電轉(zhuǎn)

慢病毒

適用細(xì)胞

部分細(xì)胞

幾乎所有細(xì)胞

幾乎所有細(xì)胞

內(nèi)部4種細(xì)胞

幾乎所有細(xì)胞

部分細(xì)胞

轉(zhuǎn)染/感染效率

隨機(jī)整合

-

生物安全等級(jí)

BL1

BL1

BL2

BL1

BL1

BL1

基因裝載能力

-

-

<4-5k

-

-

-

陽(yáng)性率

周期

基因合成

2-3

2-3

2-3

2-3

2-3

2-3

病毒包裝

-

-

1

-

-

-

混合克隆篩選

1-2

1-2

1-2

1-2

1-2

1-2

單克隆篩選

>3

>3

>3

可選

可選

>3

合計(jì)

> 8-10

> 8-10

>9-11

5-7

5-7

> 8-10

工作負(fù)荷


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