I. 背景 | |
HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代發(fā)現(xiàn)的,多年來一直被公認(rèn)為引起普通感冒的原因,并在一生中引起頻繁的再感染。在成年人中,這些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%至15%,在高峰期高達(dá)35%。兒童的年發(fā)病率達(dá)到8%,最高發(fā)病率高達(dá)20%。據(jù)報(bào)道,成人中229E和OC43病毒的感染頻率為每年每100人15至25人不等,其中有80%的感染者是先前具有該感染病毒抗體的人。 根據(jù)CDC和WHO的介紹,針對(duì)HCoV-OC43的核酸診斷一般是針對(duì)ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于對(duì)應(yīng)藥物和疫苗的開發(fā)。NCBI收錄序列為KX344031.1,全長30713bp,基因編碼5個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白:S,M,N,HE和E。 以往針對(duì)試劑盒檢測(cè)限的性能評(píng)價(jià),一般是選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品,用于性能評(píng)價(jià)。但是兩者都具有很明顯的確定,首先體外轉(zhuǎn)錄的RNA,一般是很純,單一,不涉及提取,不符合臨床病毒的微環(huán)境,因此必然造成檢測(cè)靈敏度被高估,這也是存在高概率假陰性的主要原因;再次臨床陽性病毒,即使是滅活的病毒,也是存在很大的生物安全隱患,因此要求實(shí)驗(yàn)室級(jí)別為P3-P4,大部分開發(fā)診斷試劑盒單位都不滿足改要求,另外臨床陽性病毒也是來源很有限,不能被穩(wěn)定供應(yīng),反復(fù)用于試劑盒的性能評(píng)價(jià)。 |
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II.產(chǎn)品描述 | |
有病毒的完整包膜結(jié)構(gòu),有HCoV-OC43對(duì)應(yīng)的核酸序列,但是生物安全風(fēng)險(xiǎn)較低的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,完美的克服了選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品的缺點(diǎn),非常適合用于核酸診斷性能評(píng)價(jià)的標(biāo)準(zhǔn)品。 構(gòu)建過程:HCoV-OC43基因合成→假病毒包裝→純化→QC檢測(cè)(ddPCR) |
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III. 產(chǎn)品介紹 | |
產(chǎn)品名稱: | hCov-OC43-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference |
對(duì)應(yīng)序列(詳情見附錄): |
ORF1ab/RdRP(2783bp) |
產(chǎn)品規(guī)格: | 1ml |
拷貝數(shù): | >1x10e7copies/ml |
生物安全級(jí)別: | P2 |
運(yùn)輸與保存方式: | 干冰運(yùn)輸,-90 ~ -70°C保存 |
有效期: | |
IV. 產(chǎn)品用途與優(yōu)勢(shì) | |
產(chǎn)品用途: | HCoV-OC43診斷試劑盒性能評(píng)價(jià) |
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì): | • HCoV-OC43的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,區(qū)別于以往體外合成的RNA、臨床陽性活病毒,完美克服兩者的缺點(diǎn),真正適合用于試劑盒的性能評(píng)價(jià),包含檢測(cè)限、特異性,重復(fù)性等;
• 根據(jù)HCoV-OC43冠狀病毒的特點(diǎn),選取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計(jì)3個(gè)區(qū)段的序列,用于假病毒的包裝,3個(gè)區(qū)段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列; • 科佰生物設(shè)計(jì)了ddPCR體系的引物、探針序列,可不需要構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線的前提下完成對(duì)假病毒的QC拷貝數(shù)檢測(cè),非常準(zhǔn)確表征標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù),而且克服了Q-PCR分析CT值的相對(duì)判斷標(biāo)準(zhǔn)的不準(zhǔn)確性; • 假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,無致病性,可再生,質(zhì)控方法可靠,批次間穩(wěn)定,可以長期穩(wěn)定制備和供應(yīng),而且要求實(shí)驗(yàn)室生物安全級(jí)別為P2,滿足很多單位的安全需求。 |
Ⅴ. 附錄 | |
ORF1ab/RdRP: TCAAAAGATACTAATTTTTTAAACGGGTTCGGGGTACGAGTGTAGATGCCCGTCTCGTACCCTGCGCCAGTGGTTTATCTACTGATGTACAATTAAGGGCATTTGATATTTACAATGCTAGTG TTGCTGGCATTGGTTTACATTTAAAAGTTAATTGTTGCCGTTTTCAGCGTGTTGATGAGAACGGTGATAAATTAGATCAGTTCTTTGTTGTTAAGAGGACAGATCTGACTATATATAATAGAG AGATGAAATGCTATGAGCGTGTAAAAGATTGTAAGTTTGTGGCTGAACACGATTTCTTTACATTTGATGTAGAAGGTAGTCGTGTGCCACACATTGTACGCAAGGATTTAACAAAGTATACTA TGTTGGATCTTTGCTATGCATTGCGACATTTTGATCGCAATGATTGCATGCTGCTTTGTGACATTCTCTCTATATATGCTGGTTGTGAACAATCCTACTTTACTAAGAAGGATTGGTATGATT TTGTTGAAAATCCTGATATTATTAATGTGTATAAAAAGCTAGGACCTATTTTTAATAGAGCCCTAGTTAGCGCTACTGAGTTTGCGGACAAATTGGTGGAGGTAGGCTTAGTAGGCGTTTTAA CACTTGATAATCAAGATTTAAATGGTAAATGGTATGATTTTGGTGACTATGTTATTGCAGCCCCAGGATGTGGTGTTGCTATAGCAGATTCTTATTATTCTTATATCATGCCTATGCTGACCA TGTGTCATGCATTGGATTGCGAATTGTATGTGAATAATGCTTATAGACTATTTGATCTTGTACAGTATGATTTTACTGATTACAAGCTTGAATTGTTTAATAAGTATTTTAAGCACTGGAGTA TGCCATATCATCCTAACACTGTTGATTGTCAGGATGATCGGTGTATTATACATTGTGCTAATTTTAACATACTTTTTAGTATGGTTTTACCTAATACATGTTTTGGGCCTCTTGTTAGGCAAA TTTTTGTGGATGGTGTGCCTTTTGTTGTTTCAATTGGCTACCATTATAAAGAACTTGGTATTGTGATGAATATGGATGTGGATACACATCGTTATCGCTTGTCTTTAAAAGACTTGCTTTTAT ATGCTGCTGATCCAGCTTTGCATGTAGCTTCTGCTAGTGCATTGTATGATTTACGCACTTGCTGTTTTAGTGTTGCCGCTATAACAAGCGGTGTAAAATTTCAAACAGTTAAACCTGGTAATT TTAATCAGGATTTTTATGATTTTGTTTTAAGTAAAGGCCTGCTTAAAGAGGGTAGCTCAGTTGATCTGAAGCACTTTTTCTTTACACAGGATGGTAATGCTGCTATTACTGATTATAATTATT ATAAGTATAATTTGCCCACCATGGTGGACATTAAGCAGTTGTTGTTTGTTTTGGAAGTTGTTTATAAGTATTTTGAGATTTATGATGGTGGGTGTATACCGGCATCACAAGTCATTGTTAATA ATTATGATAAGAGTGCTGGCTATCCATTTAACAAATTTGGAAAAGCCAGGCTCTATTATGAAGCATTATCATTTGAGGAACAGGATGAAATTTACGCTTATACTAAGCGTAATGTCCTGCCAA CACTTACTCAAATGAATTTGAAATATGCTATTAGTGCTAAGAATAGAGCCCGCACTGTTGCTGGTGTTTCCATACTTAGTACTATGACTGGCAGAATGTTTCATCAAAAATGTTTGAAAAGTA TAGCAGCTACACGTGGTGTTCCTGTAGTTATAGGCACCACTAAATTTTATGGTGGCTGGGATGATATGTTACGCCGCCTTATTAAAGATGTTGACAATCCTGTACTTATGGGTTGGGATTATC CTAAGTGTGATCGTGCTATGCCAAACCTACTACGTATTGTTAGTAGTTTGGTATTAGCCCGAAAACATGAGACATGTTGTTCGCAAAGCGATAGGTTTTATCGACTTGCGAATGAATGCGCAC AAGTTTTGAGTGAAATTGTTATGTGTGGTGGCTGTTATTATGTTAAGCCTGGTGGCACTAGTAGTGGTGATGCAACTACTGCTTTTGCTAATTCAGTCTTTAACATATGTCAAGCTGTTTCAG CCAATGTATGTGCCTTAATGTCATGCAATGGCAATAAGATTGAAGATCTTAGTATACGTGCTCTTCAGAAGCGCTTATACTCACATGTGTATAGAAGTGATAAGGTTGATTCAACCTTTGTCA CAGAATATTATGAATTTTTAAATAAGCATTTTAGTATGATGATTTTGAGTGATGATGGGGTTGTGTGTTATAATTCTGATTATGCGTCCAAAGGGTATATTGCTAATATAAGTGCCTTTCAAC AGGTATTATATTATCAAAATAACGTTTTTATGTCAGAATCCAAATGTTGGGTTGAACATGACATAAATAATGGACCTCATGAATTCTGTTCACAACACACAATGCTTGTAAAGATGGATGGTG ACGATGTCTACCTTCCATATCCTAATCCTAGTCGTATATTAGGAGCTGGATGTTTTGTAGATGATTTGTTAAAGACTGATAGTGTTCTTTTAATAGAACGATTTGTAAGTCTTGCAATAGATG CTTATCCACTTGTGTATCATGAAAATGAAGAATACCAAAAGGTTTTTCGTGTTTATTTGGCGTATATAAAGAAGTTGTACAATGACCTGGGTAATCAGATCTTGGATAGCTACAGTGTTATTT TAAGTACTTGTGATGGACAAAAGTTCACTGATGAGTCCTTTTACAAGAACATGTATTTAAGAAGTGCAGTTATGCAG |